Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THOP1P52888 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
THOP1P52888 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THOP1P52888 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THOP1P52888 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THOP1P52888 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THOP1P52888 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THOP1P52888 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THOP1P52888 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THOP1P52888 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THOP1P52888 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THOP1P52888 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THOP1P52888 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THOP1P52888 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
THOP1P52888 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THOP1P52888 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THOP1P52888 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THOP1P52888 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THOP1P52888 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THOP1P52888 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THOP1P52888 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THOP1P52888 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THOP1P52888 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THOP1P52888 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THOP1P52888 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THOP1P52888 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THOP1P52888 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
THOP1P52888 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THOP1P52888 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THOP1P52888 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THOP1P52888 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THOP1P52888 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THOP1P52888 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THOP1P52888 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THOP1P52888 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THOP1P52888 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THOP1P52888 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THOP1P52888 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THOP1P52888 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THOP1P52888 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THOP1P52888 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THOP1P52888 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THOP1P52888 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THOP1P52888 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THOP1P52888 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THOP1P52888 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THOP1P52888 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THOP1P52888 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THOP1P52888 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THOP1P52888 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
THOP1P52888 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THOP1P52888 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THOP1P52888 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THOP1P52888 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THOP1P52888 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THOP1P52888 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
THOP1P52888 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THOP1P52888 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THOP1P52888 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THOP1P52888 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THOP1P52888 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
THOP1P52888 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THOP1P52888 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THOP1P52888 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THOP1P52888 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THOP1P52888 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THOP1P52888 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THOP1P52888 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
THOP1P52888 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms