Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST2P52849 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST2P52849 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST2P52849 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST2P52849 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST2P52849 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST2P52849 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST2P52849 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDST2P52849 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST2P52849 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST2P52849 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST2P52849 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST2P52849 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST2P52849 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST2P52849 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST2P52849 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST2P52849 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST2P52849 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST2P52849 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST2P52849 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDST2P52849 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST2P52849 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST2P52849 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST2P52849 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST2P52849 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST2P52849 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST2P52849 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST2P52849 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST2P52849 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDST2P52849 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST2P52849 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST2P52849 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST2P52849 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST2P52849 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDST2P52849 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST2P52849 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST2P52849 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST2P52849 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST2P52849 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST2P52849 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST2P52849 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST2P52849 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST2P52849 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDST2P52849 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST2P52849 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST2P52849 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST2P52849 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST2P52849 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST2P52849 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST2P52849 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST2P52849 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST2P52849 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST2P52849 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDST2P52849 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST2P52849 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST2P52849 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST2P52849 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST2P52849 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST2P52849 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST2P52849 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST2P52849 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDST2P52849 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST2P52849 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST2P52849 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST2P52849 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST2P52849 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST2P52849 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST2P52849 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDST2P52849 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST2P52849 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST2P52849 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST2P52849 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST2P52849 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST2P52849 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST2P52849 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST2P52849 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST2P52849 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST2P52849 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDST2P52849 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST2P52849 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST2P52849 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST2P52849 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST2P52849 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDST2P52849 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST2P52849 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST2P52849 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST2P52849 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST2P52849 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST2P52849 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST2P52849 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDST2P52849 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST2P52849 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST2P52849 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST2P52849 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST2P52849 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST2P52849 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST2P52849 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST2P52849 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST2P52849 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDST2P52849 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms