Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA3P52797 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA3P52797 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA3P52797 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA3P52797 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EFNA3P52797 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA3P52797 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA3P52797 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA3P52797 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA3P52797 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA3P52797 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA3P52797 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA3P52797 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA3P52797 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA3P52797 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA3P52797 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA3P52797 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA3P52797 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA3P52797 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA3P52797 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA3P52797 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA3P52797 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA3P52797 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA3P52797 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA3P52797 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA3P52797 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA3P52797 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA3P52797 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA3P52797 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA3P52797 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EFNA3P52797 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA3P52797 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EFNA3P52797 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA3P52797 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFNA3P52797 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms