Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR5P51681 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR5P51681 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR5P51681 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR5P51681 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR5P51681 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR5P51681 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR5P51681 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR5P51681 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR5P51681 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR5P51681 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR5P51681 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR5P51681 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR5P51681 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR5P51681 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR5P51681 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR5P51681 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR5P51681 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR5P51681 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR5P51681 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCR5P51681 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR5P51681 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR5P51681 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR5P51681 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR5P51681 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR5P51681 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR5P51681 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR5P51681 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR5P51681 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR5P51681 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR5P51681 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR5P51681 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR5P51681 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR5P51681 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR5P51681 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR5P51681 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR5P51681 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR5P51681 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR5P51681 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR5P51681 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR5P51681 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR5P51681 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR5P51681 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR5P51681 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR5P51681 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR5P51681 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR5P51681 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR5P51681 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR5P51681 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR5P51681 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR5P51681 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR5P51681 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR5P51681 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR5P51681 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR5P51681 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR5P51681 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR5P51681 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR5P51681 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR5P51681 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR5P51681 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR5P51681 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR5P51681 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR5P51681 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR5P51681 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR5P51681 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR5P51681 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR5P51681 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR5P51681 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR5P51681 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR5P51681 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR5P51681 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR5P51681 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR5P51681 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR5P51681 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR5P51681 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR5P51681 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR5P51681 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCR5P51681 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCR5P51681 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR5P51681 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR5P51681 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR5P51681 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR5P51681 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR5P51681 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR5P51681 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR5P51681 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR5P51681 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR5P51681 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR5P51681 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR5P51681 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR5P51681 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR5P51681 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR5P51681 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR5P51681 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR5P51681 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR5P51681 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR5P51681 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR5P51681 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR5P51681 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR5P51681 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms