Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB28P51157 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB28P51157 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB28P51157 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB28P51157 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB28P51157 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB28P51157 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB28P51157 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB28P51157 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB28P51157 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB28P51157 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB28P51157 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB28P51157 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB28P51157 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB28P51157 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB28P51157 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB28P51157 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB28P51157 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB28P51157 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB28P51157 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB28P51157 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB28P51157 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB28P51157 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB28P51157 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB28P51157 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB28P51157 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB28P51157 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB28P51157 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB28P51157 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB28P51157 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB28P51157 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB28P51157 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB28P51157 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB28P51157 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB28P51157 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB28P51157 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB28P51157 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB28P51157 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB28P51157 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB28P51157 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB28P51157 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB28P51157 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB28P51157 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB28P51157 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB28P51157 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB28P51157 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB28P51157 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB28P51157 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB28P51157 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB28P51157 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB28P51157 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB28P51157 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB28P51157 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB28P51157 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB28P51157 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB28P51157 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB28P51157 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB28P51157 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB28P51157 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB28P51157 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB28P51157 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB28P51157 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB28P51157 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB28P51157 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB28P51157 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB28P51157 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB28P51157 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB28P51157 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB28P51157 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB28P51157 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB28P51157 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB28P51157 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB28P51157 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB28P51157 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB28P51157 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB28P51157 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB28P51157 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB28P51157 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB28P51157 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB28P51157 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB28P51157 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB28P51157 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB28P51157 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms