Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCT8P50990 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8P50990 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8P50990 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCT8P50990 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCT8P50990 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8P50990 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8P50990 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8P50990 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8P50990 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8P50990 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8P50990 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8P50990 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8P50990 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8P50990 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8P50990 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8P50990 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCT8P50990 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8P50990 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8P50990 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8P50990 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8P50990 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8P50990 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8P50990 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCT8P50990 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8P50990 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8P50990 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8P50990 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8P50990 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8P50990 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8P50990 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8P50990 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8P50990 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8P50990 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCT8P50990 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8P50990 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8P50990 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8P50990 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8P50990 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8P50990 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8P50990 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8P50990 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8P50990 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8P50990 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8P50990 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8P50990 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCT8P50990 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCT8P50990 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCT8P50990 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT8P50990 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT8P50990 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT8P50990 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT8P50990 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT8P50990 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT8P50990 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCT8P50990 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCT8P50990 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 482.2 ms