Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CASP4P49662 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASP4P49662 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASP4P49662 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP4P49662 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP4P49662 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASP4P49662 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP4P49662 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP4P49662 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP4P49662 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP4P49662 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP4P49662 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP4P49662 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP4P49662 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP4P49662 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASP4P49662 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP4P49662 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP4P49662 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP4P49662 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP4P49662 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP4P49662 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP4P49662 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP4P49662 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP4P49662 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP4P49662 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP4P49662 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASP4P49662 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP4P49662 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP4P49662 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP4P49662 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP4P49662 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP4P49662 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP4P49662 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP4P49662 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP4P49662 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP4P49662 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP4P49662 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP4P49662 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP4P49662 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP4P49662 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP4P49662 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP4P49662 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP4P49662 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP4P49662 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP4P49662 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP4P49662 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP4P49662 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP4P49662 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP4P49662 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP4P49662 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP4P49662 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP4P49662 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP4P49662 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP4P49662 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP4P49662 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP4P49662 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP4P49662 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP4P49662 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP4P49662 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP4P49662 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP4P49662 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP4P49662 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP4P49662 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP4P49662 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP4P49662 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP4P49662 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP4P49662 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP4P49662 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP4P49662 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP4P49662 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP4P49662 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP4P49662 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP4P49662 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP4P49662 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP4P49662 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP4P49662 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP4P49662 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP4P49662 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP4P49662 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP4P49662 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP4P49662 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP4P49662 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP4P49662 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP4P49662 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP4P49662 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms