Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNBP48739 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNBP48739 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms