Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
NESP48681 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NESP48681 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
NESP48681 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
NESP48681 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NESP48681 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
NESP48681 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
NESP48681 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NESP48681 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
NESP48681 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NESP48681 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
NESP48681 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
NESP48681 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NESP48681 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NESP48681 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NESP48681 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NESP48681 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NESP48681 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NESP48681 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NESP48681 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NESP48681 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
NESP48681 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NESP48681 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
NESP48681 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NESP48681 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NESP48681 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NESP48681 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC39.94■■■■□ 3.98
NESP48681 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NESP48681 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NESP48681 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NESP48681 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NESP48681 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
NESP48681 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NESP48681 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NESP48681 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NESP48681 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NESP48681 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NESP48681 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
NESP48681 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
NESP48681 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
NESP48681 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
NESP48681 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
NESP48681 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
NESP48681 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
NESP48681 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
NESP48681 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
NESP48681 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
NESP48681 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
NESP48681 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
NESP48681 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
NESP48681 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
NESP48681 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NESP48681 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NESP48681 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
NESP48681 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NESP48681 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NESP48681 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
NESP48681 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
NESP48681 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
NESP48681 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
NESP48681 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NESP48681 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
NESP48681 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
NESP48681 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
NESP48681 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
NESP48681 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
NESP48681 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
NESP48681 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
NESP48681 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
NESP48681 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
NESP48681 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
NESP48681 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
NESP48681 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
NESP48681 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NESP48681 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
NESP48681 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NESP48681 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
NESP48681 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NESP48681 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NESP48681 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NESP48681 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
NESP48681 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
NESP48681 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
NESP48681 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NESP48681 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NESP48681 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
NESP48681 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NESP48681 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
NESP48681 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
NESP48681 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
NESP48681 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
NESP48681 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
NESP48681 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
NESP48681 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
NESP48681 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NESP48681 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
NESP48681 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NESP48681 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NESP48681 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NESP48681 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms