Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSSP48449 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSSP48449 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSSP48449 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSSP48449 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSSP48449 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSSP48449 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LSSP48449 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSSP48449 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSSP48449 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSSP48449 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSSP48449 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSSP48449 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSSP48449 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSSP48449 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSSP48449 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSSP48449 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSSP48449 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSSP48449 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSSP48449 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSSP48449 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSSP48449 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSSP48449 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSSP48449 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSSP48449 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSSP48449 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSSP48449 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSSP48449 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSSP48449 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSSP48449 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSSP48449 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSSP48449 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSSP48449 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSSP48449 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSSP48449 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSSP48449 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSSP48449 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSSP48449 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSSP48449 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSSP48449 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSSP48449 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSSP48449 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSSP48449 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSSP48449 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSSP48449 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSSP48449 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSSP48449 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LSSP48449 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSSP48449 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSSP48449 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSSP48449 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LSSP48449 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSSP48449 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSSP48449 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSSP48449 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSSP48449 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSSP48449 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSSP48449 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LSSP48449 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSSP48449 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSSP48449 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSSP48449 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSSP48449 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSSP48449 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSSP48449 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LSSP48449 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSSP48449 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSSP48449 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSSP48449 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSSP48449 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSSP48449 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms