Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV4P43268 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV4P43268 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV4P43268 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV4P43268 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV4P43268 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV4P43268 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV4P43268 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV4P43268 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV4P43268 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV4P43268 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV4P43268 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV4P43268 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV4P43268 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV4P43268 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV4P43268 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV4P43268 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV4P43268 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV4P43268 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV4P43268 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV4P43268 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV4P43268 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV4P43268 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV4P43268 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV4P43268 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV4P43268 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV4P43268 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV4P43268 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV4P43268 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV4P43268 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV4P43268 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV4P43268 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV4P43268 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV4P43268 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV4P43268 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV4P43268 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV4P43268 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV4P43268 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV4P43268 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV4P43268 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV4P43268 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV4P43268 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV4P43268 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV4P43268 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV4P43268 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETV4P43268 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV4P43268 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV4P43268 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV4P43268 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV4P43268 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV4P43268 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV4P43268 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV4P43268 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV4P43268 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETV4P43268 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETV4P43268 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV4P43268 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV4P43268 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV4P43268 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV4P43268 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV4P43268 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV4P43268 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV4P43268 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV4P43268 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETV4P43268 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV4P43268 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV4P43268 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV4P43268 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETV4P43268 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV4P43268 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV4P43268 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV4P43268 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV4P43268 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV4P43268 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV4P43268 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV4P43268 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV4P43268 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV4P43268 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV4P43268 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV4P43268 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETV4P43268 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ETV4P43268 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ETV4P43268 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ETV4P43268 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ETV4P43268 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETV4P43268 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETV4P43268 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms