Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRATP43155 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRATP43155 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRATP43155 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRATP43155 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRATP43155 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRATP43155 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRATP43155 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRATP43155 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRATP43155 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRATP43155 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRATP43155 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRATP43155 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRATP43155 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CRATP43155 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRATP43155 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRATP43155 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRATP43155 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRATP43155 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRATP43155 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRATP43155 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRATP43155 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRATP43155 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRATP43155 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRATP43155 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRATP43155 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRATP43155 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRATP43155 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRATP43155 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRATP43155 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CRATP43155 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRATP43155 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRATP43155 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRATP43155 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRATP43155 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRATP43155 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRATP43155 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRATP43155 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRATP43155 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRATP43155 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRATP43155 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRATP43155 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRATP43155 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRATP43155 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRATP43155 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRATP43155 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CRATP43155 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRATP43155 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRATP43155 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRATP43155 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRATP43155 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRATP43155 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRATP43155 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRATP43155 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRATP43155 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRATP43155 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRATP43155 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRATP43155 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CRATP43155 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRATP43155 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRATP43155 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRATP43155 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRATP43155 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CRATP43155 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRATP43155 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CRATP43155 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRATP43155 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRATP43155 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRATP43155 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRATP43155 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRATP43155 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRATP43155 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRATP43155 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRATP43155 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRATP43155 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRATP43155 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRATP43155 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CRATP43155 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CRATP43155 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRATP43155 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRATP43155 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRATP43155 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRATP43155 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRATP43155 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRATP43155 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms