Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRP43088 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTGFRP43088 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTGFRP43088 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms