Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC1A1P43005 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A1P43005 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms