Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHAP40939 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHAP40939 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHAP40939 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHAP40939 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHAP40939 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHAP40939 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHAP40939 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHAP40939 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HADHAP40939 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HADHAP40939 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHAP40939 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHAP40939 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHAP40939 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHAP40939 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HADHAP40939 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHAP40939 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHAP40939 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHAP40939 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHAP40939 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHAP40939 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHAP40939 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHAP40939 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHAP40939 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHAP40939 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHAP40939 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HADHAP40939 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHAP40939 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHAP40939 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHAP40939 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHAP40939 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHAP40939 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHAP40939 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHAP40939 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHAP40939 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHAP40939 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHAP40939 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHAP40939 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHAP40939 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HADHAP40939 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HADHAP40939 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HADHAP40939 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HADHAP40939 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HADHAP40939 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HADHAP40939 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHAP40939 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHAP40939 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHAP40939 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHAP40939 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHAP40939 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHAP40939 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHAP40939 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHAP40939 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHAP40939 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HADHAP40939 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHAP40939 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHAP40939 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHAP40939 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHAP40939 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHAP40939 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HADHAP40939 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HADHAP40939 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHAP40939 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHAP40939 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHAP40939 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHAP40939 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHAP40939 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHAP40939 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHAP40939 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHAP40939 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHAP40939 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHAP40939 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHAP40939 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHAP40939 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms