Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FEN1P39748 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FEN1P39748 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FEN1P39748 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FEN1P39748 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FEN1P39748 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FEN1P39748 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FEN1P39748 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FEN1P39748 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FEN1P39748 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FEN1P39748 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FEN1P39748 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FEN1P39748 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FEN1P39748 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FEN1P39748 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FEN1P39748 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FEN1P39748 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FEN1P39748 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FEN1P39748 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FEN1P39748 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FEN1P39748 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FEN1P39748 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FEN1P39748 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FEN1P39748 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FEN1P39748 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FEN1P39748 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FEN1P39748 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FEN1P39748 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FEN1P39748 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FEN1P39748 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FEN1P39748 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FEN1P39748 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FEN1P39748 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FEN1P39748 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FEN1P39748 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FEN1P39748 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FEN1P39748 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FEN1P39748 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FEN1P39748 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FEN1P39748 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FEN1P39748 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FEN1P39748 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FEN1P39748 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FEN1P39748 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FEN1P39748 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FEN1P39748 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FEN1P39748 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FEN1P39748 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FEN1P39748 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FEN1P39748 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FEN1P39748 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FEN1P39748 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FEN1P39748 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FEN1P39748 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FEN1P39748 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FEN1P39748 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FEN1P39748 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FEN1P39748 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms