Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFBP38117 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFBP38117 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFBP38117 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFBP38117 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFBP38117 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFBP38117 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFBP38117 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFBP38117 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ETFBP38117 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETFBP38117 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETFBP38117 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETFBP38117 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETFBP38117 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETFBP38117 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETFBP38117 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETFBP38117 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ETFBP38117 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETFBP38117 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ETFBP38117 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFBP38117 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFBP38117 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFBP38117 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFBP38117 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFBP38117 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFBP38117 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFBP38117 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFBP38117 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFBP38117 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFBP38117 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFBP38117 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFBP38117 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ETFBP38117 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFBP38117 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFBP38117 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFBP38117 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFBP38117 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFBP38117 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFBP38117 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFBP38117 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFBP38117 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFBP38117 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFBP38117 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFBP38117 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ETFBP38117 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFBP38117 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFBP38117 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFBP38117 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFBP38117 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFBP38117 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFBP38117 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFBP38117 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFBP38117 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFBP38117 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ETFBP38117 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFBP38117 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFBP38117 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFBP38117 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFBP38117 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFBP38117 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFBP38117 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ETFBP38117 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFBP38117 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFBP38117 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFBP38117 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFBP38117 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFBP38117 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFBP38117 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFBP38117 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFBP38117 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ETFBP38117 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETFBP38117 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETFBP38117 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETFBP38117 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETFBP38117 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETFBP38117 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETFBP38117 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETFBP38117 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ETFBP38117 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETFBP38117 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETFBP38117 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETFBP38117 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETFBP38117 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETFBP38117 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETFBP38117 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETFBP38117 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ETFBP38117 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFBP38117 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFBP38117 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFBP38117 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFBP38117 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFBP38117 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFBP38117 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFBP38117 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFBP38117 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFBP38117 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFBP38117 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFBP38117 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFBP38117 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ETFBP38117 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms