Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGP37231 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGP37231 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGP37231 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGP37231 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGP37231 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGP37231 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGP37231 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGP37231 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGP37231 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGP37231 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGP37231 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGP37231 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGP37231 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGP37231 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGP37231 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGP37231 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGP37231 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGP37231 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGP37231 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGP37231 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGP37231 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGP37231 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGP37231 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGP37231 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGP37231 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGP37231 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGP37231 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGP37231 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGP37231 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPARGP37231 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGP37231 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGP37231 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGP37231 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGP37231 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGP37231 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGP37231 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGP37231 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGP37231 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGP37231 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGP37231 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGP37231 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGP37231 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGP37231 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGP37231 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGP37231 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGP37231 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGP37231 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGP37231 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGP37231 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGP37231 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGP37231 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGP37231 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGP37231 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGP37231 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGP37231 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGP37231 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGP37231 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGP37231 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGP37231 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGP37231 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGP37231 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGP37231 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGP37231 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGP37231 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGP37231 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGP37231 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGP37231 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGP37231 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGP37231 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGP37231 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGP37231 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGP37231 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGP37231 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGP37231 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPARGP37231 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPARGP37231 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPARGP37231 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPARGP37231 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPARGP37231 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGP37231 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGP37231 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGP37231 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGP37231 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGP37231 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGP37231 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms