Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTBRP36941 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTBRP36941 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LTBRP36941 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTBRP36941 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LTBRP36941 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LTBRP36941 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTBRP36941 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTBRP36941 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBRP36941 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBRP36941 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBRP36941 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBRP36941 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBRP36941 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBRP36941 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBRP36941 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBRP36941 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBRP36941 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBRP36941 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBRP36941 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBRP36941 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBRP36941 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBRP36941 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBRP36941 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBRP36941 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBRP36941 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBRP36941 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBRP36941 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBRP36941 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBRP36941 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBRP36941 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBRP36941 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBRP36941 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBRP36941 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBRP36941 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBRP36941 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBRP36941 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBRP36941 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBRP36941 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBRP36941 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBRP36941 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBRP36941 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBRP36941 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBRP36941 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBRP36941 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBRP36941 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBRP36941 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBRP36941 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBRP36941 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBRP36941 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBRP36941 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBRP36941 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBRP36941 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBRP36941 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTBRP36941 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBRP36941 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBRP36941 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBRP36941 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBRP36941 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBRP36941 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBRP36941 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBRP36941 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBRP36941 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBRP36941 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBRP36941 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBRP36941 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBRP36941 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBRP36941 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBRP36941 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBRP36941 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBRP36941 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBRP36941 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBRP36941 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBRP36941 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBRP36941 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBRP36941 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBRP36941 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBRP36941 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBRP36941 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBRP36941 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBRP36941 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBRP36941 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBRP36941 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBRP36941 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBRP36941 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBRP36941 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBRP36941 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBRP36941 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBRP36941 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBRP36941 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBRP36941 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBRP36941 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBRP36941 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBRP36941 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBRP36941 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms