Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHRNA7P36544 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA7P36544 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms