Protein–RNA interactions for Protein: P27796

POT1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 417 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POT1	P27796	VTC2	YFL004W	2487 nt		5	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	UBP9	YER098W	2265 nt		4.99	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	YDR445C	YDR445C	408 nt		4.99	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	AAD6	YFL056C	639 nt		4.99	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	GTO1	YGR154C	1071 nt		4.99	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		4.99	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	ALG5	YPL227C	1005 nt		4.99	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	UMP1	YBR173C	447 nt		4.99	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	ARG4	YHR018C	1392 nt		4.99	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	UBA1	YKL210W	3075 nt		4.99	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	LYS2	YBR115C	4179 nt		4.99	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	WHI4	YDL224C	1950 nt		4.98	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	AIR2	YDL175C	1035 nt		4.98	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	HPM1	YIL110W	1134 nt		4.98	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	YJL107C	YJL107C	1164 nt		4.98	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		4.98	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	CIN5	YOR028C	888 nt		4.98	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		4.98	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		4.98	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	YPL245W	YPL245W	1365 nt		4.98	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	SSZ1	YHR064C	1617 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	HXT7	YDR342C	1713 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	HXT6	YDR343C	1713 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	MEF2	YJL102W	2460 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	RFA1	YAR007C	1866 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	CTS1	YLR286C	1689 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	HAP1	YLR256W	4509 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	PEX19	YDL065C	1029 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	TRM8	YDL201W	861 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	CAX4	YGR036C	720 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	XPT1	YJR133W	630 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	SOL1	YNR034W	966 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	YNG1	YOR064C	660 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	YPL278C	YPL278C	303 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	SRB6	YBR253W	366 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	UBA2	YDR390C	1911 nt		4.97	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	GDB1	YPR184W	4611 nt		4.96	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	HIR2	YOR038C	2628 nt		4.96	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	MNN2	YBR015C	1794 nt		4.96	□□□□□ -1.61
POT1	P27796	TFG1	YGR186W	2208 nt		4.96	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	GCV1	YDR019C	1203 nt		4.96	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	YER133W-A	YER133W-A	342 nt		4.96	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	MTW1	YAL034W-A	870 nt		4.96	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	RRN9	YMR270C	1098 nt		4.96	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	ICY2	YPL250C	411 nt		4.96	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	RRP3	YHR065C	1506 nt		4.96	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	ASA1	YPR085C	1332 nt		4.96	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	YIL092W	YIL092W	1902 nt		4.95	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	MPH2	YDL247W	1830 nt		4.95	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	GMC1	YDR506C	1827 nt		4.95	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	RXT3	YDL076C	885 nt		4.95	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	UBC8	YEL012W	657 nt		4.95	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	PCL6	YER059W	1263 nt		4.95	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	ALG2	YGL065C	1512 nt		4.95	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	FAP1	YNL023C	2898 nt		4.95	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	YMR102C	YMR102C	2505 nt		4.95	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	FRE1	YLR214W	2061 nt		4.95	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	HPF1	YOL155C	2904 nt		4.94	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	PUS1	YPL212C	1635 nt		4.94	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	MSC7	YHR039C	1935 nt		4.94	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	FOX2	YKR009C	2703 nt		4.94	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	YCR006C	YCR006C	474 nt		4.94	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	YJL193W	YJL193W	1209 nt		4.94	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	RFC2	YJR068W	1062 nt		4.94	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	YLR122C	YLR122C	378 nt		4.94	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	OCA1	YNL099C	717 nt		4.94	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	TRE1	YPL176C	2352 nt		4.94	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	EXO1	YOR033C	2109 nt		4.93	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	TMN2	YDR107C	2019 nt		4.93	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	KRE28	YDR532C	1158 nt		4.93	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	ZPS1	YOL154W	750 nt		4.93	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	ECM33	YBR078W	1290 nt		4.93	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	RGT1	YKL038W	3513 nt		4.93	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	RTC1	YOL138C	4026 nt		4.93	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	LYP1	YNL268W	1836 nt		4.93	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	PHO90	YJL198W	2646 nt		4.93	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	RKM2	YDR198C	1440 nt		4.92	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	YDL121C	YDL121C	450 nt		4.92	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	ACT1	YFL039C	1128 nt		4.92	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	UBI4	YLL039C	1146 nt		4.92	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	TSL1	YML100W	3297 nt		4.92	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	CAF4	YKR036C	1932 nt		4.91	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	KTR7	YIL085C	1554 nt		4.91	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	YBR138C	YBR138C	1575 nt		4.91	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	APC4	YDR118W	1959 nt		4.91	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	YOR1	YGR281W	4434 nt		4.91	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	HIS4	YCL030C	2400 nt		4.91	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	RPS0B	YLR048W	759 nt		4.91	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	RAD30	YDR419W	1899 nt		4.91	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	ASF2	YDL197C	1578 nt		4.91	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	STB2	YMR053C	2553 nt		4.9	□□□□□ -1.62
POT1	P27796	YDL012C	YDL012C	324 nt		4.9	□□□□□ -1.63
POT1	P27796	TRS23	YDR246W	660 nt		4.9	□□□□□ -1.63
POT1	P27796	YGL152C	YGL152C	678 nt		4.9	□□□□□ -1.63
POT1	P27796	GRE3	YHR104W	984 nt		4.9	□□□□□ -1.63
POT1	P27796	DBP8	YHR169W	1296 nt		4.9	□□□□□ -1.63
POT1	P27796	SLZ1	YNL196C	897 nt		4.9	□□□□□ -1.63
POT1	P27796	CWC25	YNL245C	540 nt		4.9	□□□□□ -1.63
POT1	P27796	DAK1	YML070W	1755 nt		4.9	□□□□□ -1.63
POT1	P27796	SAS10	YDL153C	1833 nt		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.8 ms