Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RPS6KB1P23443 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KB1P23443 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms