Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HRCP23327 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HRCP23327 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
HRCP23327 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
HRCP23327 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
HRCP23327 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HRCP23327 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HRCP23327 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HRCP23327 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HRCP23327 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HRCP23327 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HRCP23327 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HRCP23327 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HRCP23327 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HRCP23327 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
HRCP23327 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
HRCP23327 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HRCP23327 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HRCP23327 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
HRCP23327 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
HRCP23327 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HRCP23327 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HRCP23327 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HRCP23327 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HRCP23327 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
HRCP23327 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HRCP23327 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HRCP23327 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HRCP23327 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HRCP23327 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
HRCP23327 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
HRCP23327 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HRCP23327 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HRCP23327 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HRCP23327 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HRCP23327 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HRCP23327 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HRCP23327 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
HRCP23327 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HRCP23327 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HRCP23327 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HRCP23327 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HRCP23327 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
HRCP23327 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
HRCP23327 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HRCP23327 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
HRCP23327 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HRCP23327 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HRCP23327 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HRCP23327 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HRCP23327 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
HRCP23327 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HRCP23327 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HRCP23327 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
HRCP23327 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HRCP23327 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HRCP23327 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HRCP23327 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HRCP23327 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
HRCP23327 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HRCP23327 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
HRCP23327 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
HRCP23327 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
HRCP23327 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HRCP23327 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
HRCP23327 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HRCP23327 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
HRCP23327 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HRCP23327 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
HRCP23327 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
HRCP23327 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HRCP23327 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HRCP23327 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HRCP23327 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HRCP23327 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HRCP23327 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HRCP23327 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HRCP23327 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HRCP23327 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HRCP23327 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
HRCP23327 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HRCP23327 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HRCP23327 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HRCP23327 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
HRCP23327 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
HRCP23327 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HRCP23327 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HRCP23327 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
HRCP23327 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HRCP23327 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
HRCP23327 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HRCP23327 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HRCP23327 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
HRCP23327 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HRCP23327 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
HRCP23327 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
HRCP23327 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
HRCP23327 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
HRCP23327 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
HRCP23327 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms