Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGFR3P22607 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGFR3P22607 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms