Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CXCL3P19876 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL3P19876 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms