Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VCAM1P19320 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VCAM1P19320 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VCAM1P19320 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms