Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF3P15923 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF3P15923 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF3P15923 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF3P15923 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF3P15923 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF3P15923 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF3P15923 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF3P15923 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF3P15923 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF3P15923 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF3P15923 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF3P15923 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF3P15923 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF3P15923 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF3P15923 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF3P15923 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF3P15923 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF3P15923 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF3P15923 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF3P15923 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF3P15923 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF3P15923 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF3P15923 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF3P15923 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF3P15923 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF3P15923 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF3P15923 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF3P15923 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF3P15923 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF3P15923 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF3P15923 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF3P15923 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF3P15923 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF3P15923 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF3P15923 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF3P15923 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF3P15923 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF3P15923 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF3P15923 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF3P15923 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF3P15923 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF3P15923 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF3P15923 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF3P15923 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF3P15923 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF3P15923 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF3P15923 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF3P15923 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF3P15923 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF3P15923 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF3P15923 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF3P15923 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF3P15923 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF3P15923 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF3P15923 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF3P15923 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF3P15923 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF3P15923 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF3P15923 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF3P15923 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF3P15923 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF3P15923 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF3P15923 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF3P15923 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF3P15923 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF3P15923 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF3P15923 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF3P15923 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF3P15923 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF3P15923 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF3P15923 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF3P15923 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF3P15923 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF3P15923 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF3P15923 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF3P15923 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF3P15923 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF3P15923 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF3P15923 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF3P15923 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF3P15923 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF3P15923 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF3P15923 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF3P15923 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF3P15923 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms