Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFAPP14136 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFAPP14136 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFAPP14136 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFAPP14136 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFAPP14136 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFAPP14136 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFAPP14136 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFAPP14136 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFAPP14136 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFAPP14136 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFAPP14136 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFAPP14136 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFAPP14136 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFAPP14136 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFAPP14136 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFAPP14136 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFAPP14136 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GFAPP14136 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFAPP14136 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFAPP14136 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFAPP14136 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFAPP14136 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFAPP14136 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFAPP14136 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFAPP14136 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFAPP14136 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFAPP14136 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GFAPP14136 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GFAPP14136 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFAPP14136 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFAPP14136 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GFAPP14136 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFAPP14136 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFAPP14136 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFAPP14136 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GFAPP14136 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFAPP14136 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFAPP14136 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFAPP14136 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFAPP14136 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFAPP14136 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFAPP14136 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GFAPP14136 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFAPP14136 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFAPP14136 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFAPP14136 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GFAPP14136 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GFAPP14136 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFAPP14136 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFAPP14136 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFAPP14136 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GFAPP14136 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFAPP14136 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFAPP14136 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFAPP14136 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GFAPP14136 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GFAPP14136 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFAPP14136 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFAPP14136 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFAPP14136 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFAPP14136 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFAPP14136 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFAPP14136 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFAPP14136 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFAPP14136 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GFAPP14136 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GFAPP14136 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms