Protein–RNA interactions for Protein: P13385

TDGF1, Teratocarcinoma-derived growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGF1P13385 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDGF1P13385 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDGF1P13385 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDGF1P13385 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms