Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VDRP11473 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VDRP11473 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VDRP11473 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VDRP11473 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VDRP11473 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VDRP11473 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VDRP11473 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VDRP11473 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VDRP11473 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VDRP11473 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VDRP11473 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VDRP11473 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VDRP11473 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VDRP11473 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VDRP11473 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VDRP11473 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VDRP11473 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VDRP11473 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VDRP11473 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VDRP11473 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VDRP11473 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VDRP11473 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VDRP11473 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VDRP11473 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VDRP11473 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VDRP11473 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VDRP11473 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VDRP11473 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VDRP11473 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VDRP11473 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VDRP11473 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VDRP11473 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VDRP11473 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VDRP11473 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VDRP11473 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VDRP11473 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VDRP11473 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VDRP11473 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VDRP11473 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VDRP11473 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VDRP11473 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VDRP11473 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VDRP11473 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VDRP11473 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VDRP11473 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VDRP11473 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VDRP11473 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VDRP11473 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VDRP11473 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VDRP11473 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VDRP11473 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VDRP11473 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VDRP11473 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VDRP11473 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VDRP11473 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VDRP11473 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VDRP11473 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VDRP11473 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VDRP11473 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VDRP11473 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VDRP11473 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VDRP11473 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VDRP11473 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VDRP11473 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VDRP11473 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VDRP11473 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VDRP11473 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VDRP11473 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VDRP11473 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VDRP11473 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VDRP11473 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VDRP11473 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VDRP11473 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VDRP11473 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VDRP11473 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VDRP11473 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VDRP11473 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VDRP11473 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VDRP11473 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VDRP11473 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VDRP11473 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VDRP11473 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VDRP11473 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDRP11473 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms