Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMP1P11279 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMP1P11279 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMP1P11279 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMP1P11279 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP1P11279 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms