Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC192P0DO97 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC192P0DO97 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms