Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L7P0C7H9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP17L7P0C7H9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP17L7P0C7H9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP17L7P0C7H9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms