Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
POLA1P09884 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
POLA1P09884 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
POLA1P09884 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
POLA1P09884 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
POLA1P09884 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
POLA1P09884 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
POLA1P09884 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
POLA1P09884 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
POLA1P09884 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
POLA1P09884 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
POLA1P09884 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC38.51■■■■□ 3.76
POLA1P09884 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
POLA1P09884 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
POLA1P09884 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
POLA1P09884 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
POLA1P09884 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
POLA1P09884 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
POLA1P09884 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
POLA1P09884 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
POLA1P09884 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
POLA1P09884 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
POLA1P09884 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
POLA1P09884 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
POLA1P09884 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
POLA1P09884 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
POLA1P09884 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
POLA1P09884 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
POLA1P09884 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
POLA1P09884 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
POLA1P09884 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
POLA1P09884 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
POLA1P09884 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
POLA1P09884 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
POLA1P09884 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
POLA1P09884 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
POLA1P09884 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
POLA1P09884 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
POLA1P09884 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
POLA1P09884 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
POLA1P09884 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
POLA1P09884 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
POLA1P09884 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
POLA1P09884 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
POLA1P09884 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
POLA1P09884 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
POLA1P09884 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
POLA1P09884 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
POLA1P09884 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
POLA1P09884 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
POLA1P09884 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
POLA1P09884 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
POLA1P09884 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
POLA1P09884 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
POLA1P09884 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
POLA1P09884 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
POLA1P09884 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
POLA1P09884 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
POLA1P09884 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
POLA1P09884 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
POLA1P09884 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC38.4■■■■□ 3.74
POLA1P09884 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
POLA1P09884 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
POLA1P09884 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
POLA1P09884 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
POLA1P09884 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
POLA1P09884 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
POLA1P09884 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
POLA1P09884 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
POLA1P09884 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
POLA1P09884 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
POLA1P09884 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
POLA1P09884 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
POLA1P09884 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
POLA1P09884 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
POLA1P09884 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
POLA1P09884 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
POLA1P09884 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
POLA1P09884 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
POLA1P09884 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
POLA1P09884 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
POLA1P09884 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
POLA1P09884 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
POLA1P09884 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
POLA1P09884 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
POLA1P09884 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
POLA1P09884 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
POLA1P09884 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
POLA1P09884 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
POLA1P09884 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
POLA1P09884 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
POLA1P09884 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC38.34■■■■□ 3.73
POLA1P09884 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
POLA1P09884 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
POLA1P09884 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
POLA1P09884 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
POLA1P09884 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
POLA1P09884 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
POLA1P09884 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
POLA1P09884 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms