Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB1P05556 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGB1P05556 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB1P05556 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms