Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP1P03956 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP1P03956 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP1P03956 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP1P03956 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP1P03956 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP1P03956 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP1P03956 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP1P03956 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP1P03956 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP1P03956 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP1P03956 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP1P03956 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP1P03956 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP1P03956 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP1P03956 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP1P03956 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP1P03956 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP1P03956 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP1P03956 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MMP1P03956 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP1P03956 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP1P03956 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP1P03956 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP1P03956 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP1P03956 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP1P03956 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP1P03956 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP1P03956 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP1P03956 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP1P03956 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP1P03956 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP1P03956 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP1P03956 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP1P03956 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP1P03956 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP1P03956 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP1P03956 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP1P03956 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MMP1P03956 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP1P03956 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP1P03956 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP1P03956 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP1P03956 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP1P03956 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP1P03956 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP1P03956 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP1P03956 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP1P03956 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP1P03956 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MMP1P03956 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP1P03956 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP1P03956 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP1P03956 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP1P03956 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP1P03956 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP1P03956 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP1P03956 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP1P03956 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP1P03956 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP1P03956 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP1P03956 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MMP1P03956 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP1P03956 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP1P03956 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP1P03956 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP1P03956 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MMP1P03956 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MMP1P03956 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP1P03956 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP1P03956 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MMP1P03956 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms