Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGKV1-5P01602 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms