Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EGFRP00533 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
EGFRP00533 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EGFRP00533 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EGFRP00533 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EGFRP00533 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EGFRP00533 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EGFRP00533 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EGFRP00533 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EGFRP00533 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EGFRP00533 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EGFRP00533 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EGFRP00533 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EGFRP00533 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EGFRP00533 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EGFRP00533 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EGFRP00533 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EGFRP00533 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EGFRP00533 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EGFRP00533 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EGFRP00533 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EGFRP00533 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EGFRP00533 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EGFRP00533 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EGFRP00533 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EGFRP00533 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EGFRP00533 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EGFRP00533 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EGFRP00533 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EGFRP00533 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EGFRP00533 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EGFRP00533 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EGFRP00533 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EGFRP00533 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EGFRP00533 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EGFRP00533 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EGFRP00533 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EGFRP00533 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EGFRP00533 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EGFRP00533 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EGFRP00533 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EGFRP00533 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EGFRP00533 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EGFRP00533 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EGFRP00533 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EGFRP00533 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EGFRP00533 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EGFRP00533 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EGFRP00533 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EGFRP00533 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EGFRP00533 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EGFRP00533 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EGFRP00533 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EGFRP00533 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EGFRP00533 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EGFRP00533 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EGFRP00533 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EGFRP00533 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EGFRP00533 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EGFRP00533 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EGFRP00533 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
EGFRP00533 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
EGFRP00533 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EGFRP00533 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EGFRP00533 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EGFRP00533 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EGFRP00533 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EGFRP00533 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EGFRP00533 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EGFRP00533 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EGFRP00533 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EGFRP00533 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EGFRP00533 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EGFRP00533 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EGFRP00533 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EGFRP00533 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EGFRP00533 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EGFRP00533 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EGFRP00533 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
EGFRP00533 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EGFRP00533 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EGFRP00533 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EGFRP00533 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms