Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN12O95859 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSPAN12O95859 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms