Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN9O95484 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN9O95484 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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