Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN4O95460 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN4O95460 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN4O95460 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN4O95460 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN4O95460 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN4O95460 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MATN4O95460 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MATN4O95460 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MATN4O95460 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MATN4O95460 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MATN4O95460 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN4O95460 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN4O95460 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN4O95460 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN4O95460 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN4O95460 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN4O95460 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN4O95460 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN4O95460 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN4O95460 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN4O95460 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN4O95460 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN4O95460 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN4O95460 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN4O95460 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN4O95460 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN4O95460 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN4O95460 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN4O95460 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN4O95460 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN4O95460 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN4O95460 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN4O95460 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN4O95460 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN4O95460 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN4O95460 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN4O95460 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN4O95460 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN4O95460 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN4O95460 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN4O95460 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN4O95460 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN4O95460 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN4O95460 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN4O95460 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN4O95460 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN4O95460 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN4O95460 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN4O95460 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN4O95460 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN4O95460 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN4O95460 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN4O95460 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN4O95460 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN4O95460 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms