Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX3O95343 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX3O95343 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX3O95343 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX3O95343 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX3O95343 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX3O95343 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX3O95343 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX3O95343 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX3O95343 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX3O95343 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX3O95343 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX3O95343 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX3O95343 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX3O95343 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX3O95343 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX3O95343 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX3O95343 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX3O95343 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX3O95343 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX3O95343 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX3O95343 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX3O95343 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX3O95343 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX3O95343 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX3O95343 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX3O95343 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX3O95343 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX3O95343 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX3O95343 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX3O95343 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX3O95343 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX3O95343 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX3O95343 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX3O95343 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX3O95343 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX3O95343 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX3O95343 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX3O95343 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX3O95343 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX3O95343 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX3O95343 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX3O95343 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX3O95343 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX3O95343 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX3O95343 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX3O95343 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX3O95343 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX3O95343 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX3O95343 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX3O95343 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX3O95343 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX3O95343 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX3O95343 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX3O95343 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX3O95343 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX3O95343 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX3O95343 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX3O95343 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX3O95343 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX3O95343 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX3O95343 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX3O95343 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX3O95343 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX3O95343 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX3O95343 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX3O95343 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX3O95343 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX3O95343 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX3O95343 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX3O95343 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX3O95343 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX3O95343 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX3O95343 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX3O95343 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX3O95343 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX3O95343 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX3O95343 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX3O95343 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX3O95343 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX3O95343 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIX3O95343 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX3O95343 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX3O95343 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX3O95343 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX3O95343 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX3O95343 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX3O95343 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX3O95343 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX3O95343 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIX3O95343 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX3O95343 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX3O95343 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX3O95343 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX3O95343 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX3O95343 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX3O95343 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX3O95343 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX3O95343 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIX3O95343 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms