Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH16O75452 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH16O75452 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH16O75452 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH16O75452 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH16O75452 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH16O75452 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH16O75452 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH16O75452 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH16O75452 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH16O75452 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH16O75452 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH16O75452 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH16O75452 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH16O75452 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH16O75452 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH16O75452 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH16O75452 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH16O75452 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH16O75452 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH16O75452 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH16O75452 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH16O75452 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH16O75452 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH16O75452 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH16O75452 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH16O75452 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH16O75452 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH16O75452 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH16O75452 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH16O75452 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH16O75452 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH16O75452 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH16O75452 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH16O75452 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH16O75452 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH16O75452 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH16O75452 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH16O75452 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH16O75452 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH16O75452 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH16O75452 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH16O75452 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH16O75452 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH16O75452 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH16O75452 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH16O75452 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH16O75452 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH16O75452 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH16O75452 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH16O75452 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH16O75452 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH16O75452 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH16O75452 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH16O75452 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH16O75452 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH16O75452 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH16O75452 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH16O75452 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH16O75452 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH16O75452 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH16O75452 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH16O75452 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH16O75452 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH16O75452 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH16O75452 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH16O75452 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH16O75452 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH16O75452 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH16O75452 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH16O75452 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH16O75452 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH16O75452 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms