Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPFIA4O75335 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIA4O75335 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIA4O75335 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms