Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXD2O60548 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD2O60548 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms