Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNG3O60359 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG3O60359 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms