Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCA5O60264 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMARCA5O60264 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMARCA5O60264 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms