Protein–RNA interactions for Protein: O43822

C21orf2, Protein C21orf2, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf2O43822 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C21orf2O43822 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C21orf2O43822 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C21orf2O43822 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms