Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SPRY3O43610 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRY3O43610 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms