Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNQ3O43525 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNQ3O43525 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ3O43525 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
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